自3月初上線針對(duì)新冠病毒的研究后,世界上最大的分布式計(jì)算項(xiàng)目Folding@home(簡(jiǎn)稱“FAH”)就受到了全世界的矚目。
根據(jù)FAH新冠病毒項(xiàng)目負(fù)責(zé)人格雷格·鮑曼(Greg Bowman)的最新推特,截至目前,全球有100萬(wàn)的用戶志愿貢獻(xiàn)自己的算力,一起抗擊新冠疫情。其中包括英偉達(dá)40萬(wàn)游戲玩家和8萬(wàn)AMD用戶貢獻(xiàn)的GPU資源。
FAH新冠病毒項(xiàng)目負(fù)責(zé)人格雷格·鮑曼推特截圖
Folding@home成立于2000年10月1日,是一個(gè)研究蛋白質(zhì)折疊、誤折、聚合及由此引起的相關(guān)疾病的分布式計(jì)算工程。3月初,F(xiàn)AH發(fā)起新冠病毒研究項(xiàng)目,希望能利用志愿者閑置的中央處理器來(lái)構(gòu)建計(jì)算能力。要參加新冠病毒項(xiàng)目,志愿者可以下載FAH軟件,將自己計(jì)算機(jī)資源將發(fā)送到Folding@home。
隨后,包括英偉達(dá)在內(nèi)的公司呼吁公眾將其多余的計(jì)算能力捐贈(zèng)給該項(xiàng)目,該項(xiàng)目因此吸引了更多的志愿者。
眾多志愿者的加入,也讓FAH項(xiàng)目迎來(lái)一個(gè)里程碑。上周,F(xiàn)olding@home表示,自己的算力突破百億億次。相比之下,美國(guó)橡樹嶺國(guó)際實(shí)驗(yàn)室的超級(jí)計(jì)算機(jī)“頂點(diǎn)”的算力是每秒14.86億億次。
鮑曼在一封電子郵件中說(shuō):“我們還對(duì)服務(wù)器端基礎(chǔ)架構(gòu)進(jìn)行了許多改進(jìn),大多數(shù)計(jì)算資源將用于冠狀病毒?!?/p>
COVID-19 相關(guān)的蛋白質(zhì)示例 圖片來(lái)自Folding@home官網(wǎng)
Folding@home一直在嘗試通過(guò)模擬冠狀病毒的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)在微觀水平上折疊和展開的方式來(lái)開發(fā)這種大流行的治療方法。FAH在其官網(wǎng)上表示,2019-nCoV是SARS冠狀病毒(SARS-CoV)的“近親”,并且以類似的方式起作用。對(duì)于兩種冠狀病毒,當(dāng)病毒表面的蛋白質(zhì)與肺細(xì)胞上的受體蛋白質(zhì)結(jié)合時(shí),肺部感染就發(fā)生了。這種病毒蛋白稱為刺突蛋白。由于蛋白質(zhì)不會(huì)停滯,會(huì)擺動(dòng),折疊和以多種形狀展開呈現(xiàn),所以我們不僅需要研究病毒刺突蛋白的一種形狀,還需要研究該蛋白擺動(dòng)、折疊成其他形狀的所有方式,以便更好地了解其與ACE2受體是如何相互作用的,從而可以開發(fā)出治療抗體。了解這些信息,需要我們對(duì)2019-nCoV峰值蛋白的結(jié)構(gòu)進(jìn)行建模。
此前Folding@home研究的項(xiàng)目還包括阿爾茲海默病、亨廷頓舞蹈癥、牛海綿狀腦?。ǒ偱2。?、癌癥和囊胞性纖維癥。
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